L'école de journalisme de Bordeaux est créée en 1967 au sein de l'Université Bordeaux Montaigne (alors Université Bordeaux III), à l'initiative de Robert Escarpit, sociologue et journaliste au Monde et de Pierre Christin, jeune universitaire de retour des États-Unis. Leur ambition est claire : ouvrir l'accès au métier de journaliste à des étudiants issus de tous les milieux.
Installée à l'origine à Gradignan, la formation s'organise autour d'un DUT Journalisme (Bac+2). L'école est reconnue par la profession dès 1975, ce qui marque une étape majeure dans sa légitimation et son intégration au paysage national des écoles de journalisme.
En 2001, l'école et l'IUT Info-Com s'installent au centre de Bordeaux, place Renaudel, dans un bâtiment financé par la Région et sur un terrain mis à disposition par la ville de Bordeaux, renforçant ainsi leur ancrage territorial.
En 2006, une nouvelle étape est franchie sous l'impulsion d'Édith Rémond, qui transforme la structure en institut : l'IJBA voit le jour et adopte le format du Master professionnel (Bac+5), dans le cadre de la réforme LMD. La dernière promotion de DUT est diplômée en 2007, marquant la fin d'un cycle et l'entrée dans une nouvelle organisation des formations.
Depuis sa création, l'école puis l'institut ont été portés par plusieurs directions successives qui ont accompagné ses évolutions :
- Édith Rémond, qui a longtemps dirigé la formation à la suite de Pierre Christin, mène à bien la structuration de l'institut et le passage du diplôme au niveau master.
- Maria Santos-Sainz développe fortement son ouverture internationale.
- François Simon ouvre le master Journalisme à l'alternance. Il est nommé directeur du CFA Bordeaux Montaigne de 2016 à 2018.
- Depuis 2017, Arnaud Schwartz, avec le concours de Rayya Roumanos et d'une équipe très investie accompagne la transformation de la formation dans un contexte de mutations profondes du secteur (numérique, vidéo mobile, podcast, datajournalisme, algorithmes, intelligence artificielle). Il copréside, par ailleurs, la Conférence des écoles de journalisme.